Asura

Tomoharu Natsume sobreviveu a um terrível acidente de avião, mas Misao, sua amiga próxima, não sobreviveu e se tornou um fantasma que continuou ligada a ele. Três anos depois, ele se muda para um lugar alugado por seu irmão para morar sozinho e frequentar a Escola Raku, já que sua mãe se casou novamente. Em seu primeiro dia em sua nova casa, uma garota misteriosa chamada Shuri aparece e lhe entrega uma maleta prateada para ele cuidar em nome de seu irmão que mora no exterior. Logo depois, Tomoharu e sua melhor amiga, um fantasma chamado Misao Minakami, são atacados por várias facções que procuram o 'Asura Machina' e o 'Extrator'.

Após os eventos da noite anterior, Tomo e Misao ficam sabendo sobre a Royal Dark Society por Shuri. Mais tarde, ele encontra Takatsuki ao visitar seu novo senhorio e descobre que foi ela quem invadiu sua casa em busca da maleta. No entanto, logo seu pai chega e as coisas ficam estranhas para Tomo quando ele percebe que o homem foi uma das pessoas responsáveis pela destruição de sua casa. Tomo é então confrontado pelo Presidente do Primeiro Conselho Estudantil, Saeki Reishirou, que também foi uma das pessoas que invadiram sua casa.

Tendo sido capturada por Saeki, Takatsuki é julgada e sentenciada à morte por seu envolvimento com Tomo. Enquanto isso, Tomo corre para recuperar o Asura Machina e salvá-la do Primeiro Conselho Estudantil. No entanto, ao encontrar o baú vazio, ele deve contar com a ajuda de Shuri para salvar o dia.

O clube de ciências segue para o Lago Tobi para investigar relatos de uma criatura misteriosa que está aterrorizando a área. Sem o conhecimento deles, dois colegas estudantes, Kurasawa Rikka (a Presidente do Segundo Conselho Estudantil) e Mahiwa, também estão na área em busca da criatura. Logo se revela que o monstro é na verdade um familiar que foi abandonado por Mahiwa e enlouqueceu. Armado com esse conhecimento, o clube de ciências se propõe a reunir os dois e deter o ataque descontrolado da criatura.

Quando Shuri é ferida durante uma luta com um Asura Machina, sua personalidade muda completamente e ela pensa que seu nome é Kurosaki Yukari. Isso leva Tomo a investigar a vida dela, mas logo tanto Tomo quanto Shuri são atacados por uma boneca assassina, sendo salvos por Takatsuki.

Shuri combina de trocar o estabilizador real com Susugihara por algo muito importante para ela. No entanto, com Tomo ainda muito doente para usar Kurogane, não há ninguém para lutar contra ela quando a troca dá muito errado e, como tal, eles são forçados a fugir.

Agora que Kurogane absorveu o estabilizador, as pessoas podem ver Misao, mas Tomo está preocupado que ela não será capaz de esconder sua natureza incorpórea daqueles ao seu redor. Enquanto isso, Haruna e Susugihara exploram um estranho conjunto de ruínas em busca do Caster Machina. Esses eventos recentes levam o grupo a relembrar o trágico acidente de avião que deu início a tudo, não apenas para Misao e Tomo, mas também para Shuri e Susugihara.