A trama se desenrola no início dos anos 2000, quando a saída de um jovem traficante da prisão coloca a Cidade de Deus novamente em disputa. Os moradores se veem presos entre traficantes, milícias e autoridades públicas, mas a necessidade de escapar desse ciclo faz com que a comunidade se una para enfrentar o opressor.
Alexandre Rodrigues • Roberta Rodrigues • Andréia Horta • Sabrina Rosa • Dhonata Augusto • Eli Ferreira • Shirley Cruz • Luellem de Castro
No ano 2000, Wilson retorna à Cidade de Deus para apoiar a campanha de Barbantinho, mas se vê em meio a um conflito quando o recém-libertado Bradock retorna para cobrar de Curió, atual dono do tráfico, o posto que ele acredita ser seu.
Enquanto fotografa a guerra do tráfico, Wilson conhece Lígia, uma repórter que investiga a corrupção policial. Sua filha Leka tenta a carreira musical e Berenice luta para manter seu namorado PQD longe do crime.
Em meio à guerra territorial, Leka e seu grupo de rap cortejam um produtor musical. Enquanto isso, Lígia e Wilson investigam as ações das milícias, PQD aproveita seu histórico militar para ajudar Curió, e Jerusa orquestra uma emboscada.
Após assumir o controle, Bradock procura criar confiança na comunidade, apesar de seu comportamento errático. Enquanto isso, Wilson e Lígia descobrem uma conexão entre um político, as milícias locais e um membro do círculo de Bradock.
Quando o BOPE invade a Cidade de Deus a mando de Reginaldo, uma onda de violência é deflagrada, forçando Barbantinho, Berenice e Wilson a enfrentarem um caos inimaginável e impactante.
Enquanto a comunidade se reúne em torno de sua campanha, Berenice recebe um aviso de Bradock. Wilson e Lígia se veem em perigo à medida que se aproximam da revelação da conspiração entre Reginaldo e traficantes de armas.